特殊監(jiān)管區(qū)之間的保稅貨物流轉(zhuǎn)兩年前就說解決了，但因為種種原因，新系統(tǒng)至今沒有投入運行，實際操作還是采用轉(zhuǎn)關運輸，如果轉(zhuǎn)關運輸取消，新系統(tǒng)又不能用，區(qū)內(nèi)企業(yè)保稅貨物流轉(zhuǎn)的問題怎么辦？

內(nèi)陸企業(yè)進口貨物口岸驗放，口岸海關的查驗工作量大幅度增加，查驗力量和查驗場地是否做好相應的配備？一些企業(yè)反映，一些口岸目前的查驗已經(jīng)處于飽和狀態(tài)，如果一下子增加很多的查驗量，口岸海關應付不了，可能導致時間拖延甚至排隊加塞尋租現(xiàn)象；

 內(nèi)陸進出口貨物全部在口岸驗放，遇到海關查驗，內(nèi)陸進出口企業(yè)就面臨從內(nèi)陸到口岸的往返奔波，一次解決不了的還要多次往返，是否會產(chǎn)生貨物通關受阻，成本增加的問題？還有一些口岸強制性要求查驗時現(xiàn)場陪同企業(yè)（包括貨主或報關代理）必須為口岸注冊機構，對沒有在口岸設點的內(nèi)地企業(yè)而言，又意味著成本增加； 

海關的通關一體化是將貨物的通關手續(xù)全部轉(zhuǎn)移到口岸，但檢驗檢疫機構卻是在把相當一部分原本在口岸進行檢驗檢疫處理的貨物轉(zhuǎn)到收發(fā)貨人所在地處理，兩個機構之間缺乏協(xié)調(diào)，企業(yè)夾在中間無所適從；

 企業(yè)認為： 和普通列車相比，高鐵在速度、舒適度、車內(nèi)衛(wèi)生等很多方面都有顯著優(yōu)勢，但并不意味高鐵通了，所有的綠皮車就應該馬上停止運行。應該給企業(yè)留下選擇的機會和逐步適應、接受的過程。海關通關一體化可以提高通關效率，降低通關成本，對企業(yè)而言，是非常好的事情，但原先的轉(zhuǎn)關運輸還有一點，就是進口貨物運抵的可預見性是比較確定的，對很多實行零庫存的電子行業(yè)來說，可預見性同樣非常重要，一旦供應鏈斷裂，就會導致停產(chǎn)、交貨延期等不良后果；

企業(yè)呼吁，轉(zhuǎn)關運輸已經(jīng)實施了幾十年，做出重大調(diào)整前應該進行調(diào)研、論證，聽聽企業(yè)的意見，把好事真正做好；

最后企業(yè)也反映，這次的48號公告在實施前提前兩個半月就公布了，給基層海關和企業(yè)留出了較為充裕的準備時間，也給海關自己留了一點調(diào)整的時間，希望其他的政策法規(guī)和制度的出臺也能這樣。